События Fate/Apocrypha происходят в мире параллельном миру Fate/stay night, в котором Грааль был убран из города Фуюки после Третьей Войны. История начинается с того, что в Румынии был обнаружен «726-ой Святой Грааль». Его похитила и привезла в Румынию семья Иггдмилленния.

Это знаменует начало Великой Войны Святого Грааля в городе Трифас с двумя противоборствующими сторонами: Чёрная Фракция, члены которой являются частью семьи Иггдмилленния и Красная Фракция, члены которой были посланы Ассоциацией Магов, за исключением одного участника от Церкви. Грааль также призывает Рулера выступать в качестве посредника в Войне Святого Грааля.

Связанная манга:
1. Fate/Stay Night (2006)
2. Fate Kaleid Liner Prisma Ilya (2008)
3. Fate Kaleid Liner Prisma Ilya 2wei (2009)
4. Fate/Zero (2010)
5. Fate/Extra (2011)
6. Fate/Kaleid Liner Prisma Illya 3rei!! (2012)
7. Fate/Prototype - Tribute Phantasm (2012)
8. Fate/Prototype - Soukan no Fragments (2013)
9. Fate/Extra CCC - Foxtail (2013)
10. Fate/Strange Fake (2015)
11. Fate/Stay Night: Heaven's Feel (2015)
12. Fate/Apocrypha (2016)
13. Lord El-Melloi II Case Files (2017)
14. Teito Seihai Kitan Fate/type Redline (2019)