Действие манги разворачивается в женской католической академии св. Лилианы. Важнейшей отличительной чертой данной академии является Ямаюрикай – школьный совет, который возглавляют три Розы – Chinensis (красная китайская), Foetida (жёлтая персидская) и Gigantea (белая гигантская). Девушки, которых ежегодно выбирают в Ямаюрикай, должны наставлять и поучать многочисленное сестринство. В Лилиане также существует система «soeurs» – младших сестёр, когда любая девушка может выбрать себе младшую сестру, скрепляя союз розарием – ожерельем с распятием. Младшую сестру, которую выберет себе одна из Роз, называют «en bouton», бутоном Розы.

В центре повествования ничем непримечательная первогодка Фукудзава Юми, которая волею случая удостаивается мимолётного внимания бутона Розы Chinensis, несравненной Огасавары Сатико. С этой встречи, предопределившей судьбу их обеих, начинается неспешное повествование об ученицах Сада Роз.
Адаптация ранобэ «Maria-sama ga Miteru» от Konno Oyuki.